MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 6289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013851	CG	3	6	239601	239606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_013851	CTGT	2	8	239677	239684	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_013851	GCA	2	6	239710	239715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_013851	AAC	2	6	239717	239722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_013851	CCG	3	9	239741	239749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_013851	GCA	2	6	241008	241013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_013851	AC	3	6	241034	241039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_013851	T	6	6	241058	241063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013851	CAT	2	6	241168	241173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_013851	CTTACA	2	12	243120	243131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_013851	CAT	2	6	243139	243144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_013851	GGGC	2	8	243261	243268	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
513	NC_013851	GTAT	2	8	243371	243378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
514	NC_013851	TTA	2	6	243402	243407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013851	CGT	2	6	243414	243419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_013851	TGT	2	6	243442	243447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_013851	ATA	2	6	243483	243488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_013851	TAT	2	6	243562	243567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013851	CAG	2	6	243603	243608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_013851	G	6	6	243710	243715	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013851	A	6	6	243840	243845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_013851	CAA	2	6	243865	243870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_013851	AGA	2	6	243901	243906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013851	GAA	3	9	243944	243952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013851	CAG	2	6	243958	243963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013851	TGT	2	6	243967	243972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013851	TCA	2	6	243995	244000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_013851	ATA	2	6	244109	244114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013851	A	6	6	244178	244183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_013851	GGAT	2	8	244309	244316	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_013851	A	6	6	244352	244357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_013851	TAA	2	6	244411	244416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013851	TAT	2	6	244435	244440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013851	AAAGT	2	10	244523	244532	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013851	T	6	6	244532	244537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013851	T	6	6	244613	244618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013851	TAA	2	6	244650	244655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013851	T	6	6	244721	244726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_013851	CTTG	2	8	244809	244816	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
540	NC_013851	CTA	2	6	244823	244828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_013851	CTG	2	6	244833	244838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_013851	CCT	2	6	244869	244874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_013851	T	6	6	245028	245033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013851	ATC	2	6	245964	245969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_013851	AGTA	2	8	246036	246043	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013851	AAAAG	2	10	246122	246131	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013851	TTC	2	6	246139	246144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_013851	CAT	2	6	246186	246191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_013851	GAT	2	6	246276	246281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013851	TAAA	2	8	246307	246314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_013851	GAA	2	6	246372	246377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013851	GTC	2	6	246410	246415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_013851	AAAGCT	2	12	246417	246428	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
554	NC_013851	A	6	6	246462	246467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_013851	TAA	2	6	246518	246523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013851	TTTA	2	8	246688	246695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_013851	TTA	2	6	246701	246706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_013851	CTT	2	6	246735	246740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_013851	CATTA	2	10	246741	246750	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
560	NC_013851	GGTT	2	8	246867	246874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013851	ACC	2	6	246883	246888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_013851	CA	3	6	246894	246899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_013851	AAC	2	6	248627	248632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_013851	T	6	6	248661	248666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013851	C	7	7	248684	248690	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
566	NC_013851	CTC	2	6	248735	248740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_013851	CGCT	2	8	248808	248815	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
568	NC_013851	TGC	2	6	249990	249995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_013851	ACC	2	6	251082	251087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_013851	TGA	2	6	251112	251117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013851	TAG	2	6	251135	251140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013851	GAG	2	6	251165	251170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013851	AGG	2	6	251236	251241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_013851	GAT	2	6	251284	251289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013851	A	6	6	251306	251311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013851	T	7	7	251352	251358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013851	TGG	2	6	251777	251782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_013851	CAAAT	2	10	252185	252194	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
579	NC_013851	GAT	2	6	252217	252222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013851	ATG	2	6	254767	254772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013851	CAGG	2	8	254880	254887	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
582	NC_013851	GTT	2	6	254888	254893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_013851	TGAT	2	8	255577	255584	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_013851	CG	3	6	255600	255605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
585	NC_013851	CG	3	6	266974	266979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
586	NC_013851	CAG	2	6	276926	276931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_013851	AT	3	6	277024	277029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013851	TGC	2	6	277049	277054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_013851	GAT	2	6	281355	281360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_013851	CCG	2	6	281370	281375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_013851	GCC	2	6	281416	281421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_013851	CAAT	2	8	281422	281429	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_013851	TGT	2	6	281489	281494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_013851	CCTG	2	8	281514	281521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
595	NC_013851	CTT	2	6	285213	285218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_013851	TGG	3	9	286588	286596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013851	CAG	2	6	286623	286628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_013851	GGC	2	6	289784	289789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_013851	TC	3	6	290442	290447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NC_013851	CGG	2	6	290451	290456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_013851	CTTC	2	8	296420	296427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_013851	CCGGA	2	10	301148	301157	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
603	NC_013851	GAC	2	6	301165	301170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_013851	GGT	2	6	302334	302339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013851	ATCCG	2	10	302340	302349	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
606	NC_013851	CGA	2	6	302386	302391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_013851	CTG	2	6	306909	306914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_013851	AACG	2	8	306923	306930	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
609	NC_013851	TGT	2	6	306936	306941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013851	ACC	2	6	307432	307437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_013851	CAA	2	6	307441	307446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_013851	AGG	2	6	308027	308032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013851	TCA	2	6	308495	308500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_013851	GAC	2	6	309800	309805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_013851	GGCG	2	8	311884	311891	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
616	NC_013851	CCG	2	6	311906	311911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_013851	GGT	2	6	315517	315522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013851	GGC	2	6	315591	315596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_013851	CGCGC	2	10	315610	315619	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
620	NC_013851	GAT	2	6	315680	315685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013851	GTC	2	6	316236	316241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_013851	GAA	2	6	316271	316276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_013851	TAG	2	6	316307	316312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_013851	TGTGA	2	10	316381	316390	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
625	NC_013851	AGC	2	6	316419	316424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_013851	AGCC	2	8	316434	316441	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
627	NC_013851	GAC	2	6	316466	316471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_013851	GGT	2	6	316499	316504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_013851	GGC	2	6	316551	316556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_013851	GC	3	6	316555	316560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
631	NC_013851	AC	3	6	316669	316674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
632	NC_013851	TCC	2	6	319837	319842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_013851	AAC	2	6	319869	319874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_013851	GTC	2	6	319895	319900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_013851	CGGCT	2	10	319906	319915	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
636	NC_013851	ACCC	2	8	319970	319977	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
637	NC_013851	TGCG	2	8	319992	319999	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
638	NC_013851	GCT	2	6	320038	320043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_013851	CGG	2	6	320120	320125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_013851	ACA	2	6	320142	320147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_013851	ATC	2	6	320303	320308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_013851	GGC	2	6	320342	320347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_013851	GGT	2	6	320363	320368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
644	NC_013851	CGC	2	6	320404	320409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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647	NC_013851	TGC	2	6	320522	320527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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650	NC_013851	CTGC	2	8	323919	323926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
651	NC_013851	GT	3	6	325344	325349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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653	NC_013851	TGT	2	6	325404	325409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
654	NC_013851	GGATGA	2	12	325410	325421	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
655	NC_013851	GTC	2	6	325429	325434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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657	NC_013851	CGTC	2	8	325510	325517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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661	NC_013851	GTG	2	6	329902	329907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
662	NC_013851	GT	3	6	329920	329925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
663	NC_013851	GCG	2	6	329968	329973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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671	NC_013851	GGC	2	6	336129	336134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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673	NC_013851	GGTCG	2	10	336162	336171	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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681	NC_013851	CCT	2	6	339216	339221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
682	NC_013851	TCC	2	6	339302	339307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
683	NC_013851	ACC	2	6	339324	339329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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685	NC_013851	CTG	2	6	339719	339724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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725	NC_013851	CGG	2	6	359603	359608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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766	NC_013851	GCC	2	6	391762	391767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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888	NC_013851	CAA	2	6	451003	451008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
889	NC_013851	GCG	2	6	451040	451045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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891	NC_013851	GTG	2	6	453611	453616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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894	NC_013851	TGAG	2	8	464544	464551	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
895	NC_013851	G	6	6	464597	464602	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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897	NC_013851	CGG	2	6	467510	467515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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